Les cellules souches du sang se situent dans la moelle osseuse. La moelle osseuse se trouve surtout dans le crâne et dans le tissu osseux spongieux du squelette humain (côtes, colonne vertébrale et os du bassin).

La moelle osseuse ne doit pas être confondue avec la moelle épinière, qui est une partie du système nerveux. Il n’y a donc pas lieu de craindre qu’un don de moelle osseuse puisse entraîner des lésions de la moelle épinière.

On trouve aussi des cellules souches du sang dans le sang lui-même, mais en très faibles quantités. Pour pouvoir en prélever, il faut donc d’abord augmenter leur nombre au moyen d’un traitement médicamenteux. On parle dans ce cas de don «périphérique» de cellules souches.

On trouve aussi des cellules souches du sang dans le cordon ombilical et dans le sang de cordon.